随着电力系统电力电子化程度提升，系统中谐波大幅增加，准确追溯谐波扰动源头可精准评估各级节点对电能质量的影响因子，为谐波的针对性治理提供重要支撑。然而，电网的大规模谐波溯源存在挑战：电能质量监测设备间谐波数据采样存在不同时性问题，谐波监测数据时域精确度较低、有效性不足，经溯源过程计算分析，误差被放大将影响量化结果和溯源效果；多谐波源系统中，不同频段阻抗特性复杂化，将影响对特定频次、单一扰动源头的精准追溯。针对上述问题，采用基于不同节点时间尺度基准的谐波状态估计法，进行谐波监测数据的同步性筛选；聚焦不同频段阻抗特性复杂化问题，提出1种基于同节点多频段阻抗对比的多谐波源溯源方法；横向对比同节点不同频段的阻抗结果，可有效辨识各个潜在谐波源节点并量化表征其谐波出力贡献度。最后，搭建含多个新能源场站基地的多谐波源电力系统仿真算例，对所提理论方法的有效性进行了充分验证。