针对380V电网，将单H桥结构的三电平逆变器应用于有源电力滤波器是一种非常有潜力的拓扑结构。但是由于这种拓扑结构的逆变器有三条直流母线，因此对其控制增加了一定难度，尤其是当负载电流三相不对称时，补偿负载电流中的基波负序分量会对直流母线电压的稳定带来不利影响。本文针对直流母线稳定的条件，探讨了逆变器与电网基波序分量对输入逆变器功率的影响，提出了基于正序电流的直流母线平均电压控制方法和基于负序电流的直流母线相间电压平衡控制方法，在此基础上为了消除负载电流基波负序分量对直流母线电压稳定的影响，又提出了双旋转坐标变换的谐波检测方法。最后通过仿真验证了该方法对直流母线电压稳定的可行性，并且对不平衡负载电流的补偿进行了仿真，得到了比较好的效果。