磁耦合谐振式无线电能传输系统中，当耦合系数较大时系统将发生频率分裂现象导致输出功率降低。采用软件调频的输出控制可以稳定输出性能。然而输出功率是一个极值个数和半径都可变的多峰函数，因此需要改进标准人工蜂群算法以搜索所有极值。首先通过系统模型的分析，说明频率分裂现象的影响和多峰搜索的必要性，提出一种原边控制方法，得到输出性能的函数。然后提出3种策略对标准人工蜂群算法进行改进，包括采用正交生成法改进了食物源的分布；采用比较父代与子代之间的欧式距离选择食物源，避免漏峰；通过对适应度排序确定个体增量动态地缩小小生境的范围。最后搭建了一个两线圈无线电能传输系统，通过计算和实验证明，改进的人工蜂群算法收敛速度快、优化精度高，在保证传输效率的前提下，能够提高并稳定系统在过耦合状态时的输出功率。