针对直流微电网中下垂控制方法下的母线电压动态响应问题，提出一种基于扰动观测器的变流器并联动态补偿结构。首先分析传统直流下垂控制下存在的问题，对直流微电网中多个变流器并联模型建立状态空间模型，分析并联状态下公共负载切换造成的电流变化，应用同步测量方法（PMU）对扰动电流进行测量分配，根据左右互质分解理论与尤拉参数化稳定控制器理论得出基于扰动观测器的变流器并联动态补偿结构，应用模型匹配算法求得尤拉参数化矩阵Q(s)，设计电流环补偿结构M(s)以抵消补偿信号对电流环的影响。通过仿真证明，在公共负载切换时，该结构能够加快直流母线电压的动态响应速度。同时，该结构能够抑制不平衡负载对直流母线电压造成的二倍频扰动，保持母线电压的稳定。