随着分布式发电在电网中功率注入的增加，渗透率边界对电网的规划和系统稳定具有重要意义。为了实现某电站的最大渗透率运行，本文对不同结构燃料电池储能系统渗透率边界进行了对比分析。首先介绍了电站在不同结构燃料电池储能系统下的运行模式，并建立了接口逆变器阻抗模型。在此基础上，给出了不同工作模式下接口逆变器和电网阻抗Bode图，对比分析了谐振约束下的渗透率边界。共交流母线型燃料电池储能结构中接口逆变器存在多种工作模态，导致其源侧等效阻抗复杂，易与电网阻抗相交，在较低渗透率水平下发生谐振，而在共直流母线型燃料电池储能结构中，接口逆变器具有单一工作模态，阻抗一致性好，电站的渗透率边界可以达到更高。案例分析验证了上述分析的有效性。